Maksud Logo Sekolah
Gunung - Gunung Kinabalu merupakan gunung tertinggi di Asia Tenggara yang terletak di negeri Sabah melambangkan keteguhan semangat pelajar-pelajar SK.Pomotodon.
Topi Graduan - Simbol kemuncak bagi pendidikan para pelajar.
Buku - Merupakan sumber bagi segala ilmu.
Bunga Padi - Merupakan hasil bumi yang terdapat di Pomotodon yang merupakan makanan asa penduduk di Malaysia.
Warna Hijau - Melambangkan alam semulajadi yang mendamaikan.
Warna Biru - Melambangkan keharmonian dan ketenangan.
Warna Unggu - Warna Sekolah.
* 1974 - Tahun SK.Pomotodon dibina.
